蛋白质组学分析平台

一、平台介绍

        通过纳升液相色谱-高分辨质谱联用技术，高通量分析生物样本中蛋白质、多肽和多糖等大分子的类别和含量，精确解析蛋白质翻译后修饰类型和位点对蛋白功能的影响，在蛋白和多肽水平上阐明在遗传发育、病理发生、营养调控和品质形成等过程的调控机制。

二、主要/特色技术

1、基于三级质谱定量的蛋白质高通量标记技术

       使用多通道TMT同位素标记试剂，对不同样品中的蛋白质分别进行化学标记。标记后的蛋白等比例混合，使用高pH值C18或强阳离子交换色谱进行多肽预分级，采用三级质谱进行蛋白定量分析。该技术可以同步分析6-32个样本，减少批次效应和提高蛋白鉴定数量和深度。使用三级质谱定量技术，可以消化值压缩问题，提高定量的准确性；

图1 基于三级质谱定量的蛋白质高通量标记技术

2、蛋白质糖基化修饰分析技术

       结合TMT同位素标记试剂，实现对N-糖基化蛋白的高通量和高准精度定量分析；使用EcHCD混合碎裂模式和三级质谱采集，实现同步实现对糖钛的多肽序列和糖链结构的解析，高效解析修饰糖型和修饰位点。使用多孔石墨碳色谱柱的液相色谱-质谱联用技术，高效分离不同结构的O-糖；

图2 蛋白质糖基化修饰分析技术

图3 蛋白质糖基化修饰分析技术应用范围

三、仪器设备

       蛋白质组学平台主要仪器包括超高分辨率三合一质谱仪（Thermo Fisher Orbitrap Fusion Tribrid）、液相色谱串联质谱（SCIEX QTRAP 6500）、超速离心机（Beckman Optima XE-90）、制备型蛋白纯化液相（Cytiva ÄKTATMpure 25）等。